Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO1Q147U7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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