Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCARB2Q14108 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms