Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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