Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EXOSC2Q13868 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms