Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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CDH18Q13634 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CDH18Q13634 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CDH18Q13634 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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CDH18Q13634 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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CDH18Q13634 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH18Q13634 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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