Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCIRG1Q13488 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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