Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAD4Q13485 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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