Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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