Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
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TCOF1Q13428 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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TCOF1Q13428 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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TCOF1Q13428 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCOF1Q13428 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
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TCOF1Q13428 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
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TCOF1Q13428 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TCOF1Q13428 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
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