Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CALCOCO2Q13137 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
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