Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP4Q13115 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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