Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECH1Q13011 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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