Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPN13Q12923 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPN13Q12923 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPN13Q12923 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN13Q12923 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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