Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STX4Q12846 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STX4Q12846 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
STX4Q12846 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
STX4Q12846 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms