Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TROQ12816 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TROQ12816 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TROQ12816 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TROQ12816 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TROQ12816 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TROQ12816 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TROQ12816 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TROQ12816 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TROQ12816 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TROQ12816 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TROQ12816 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TROQ12816 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TROQ12816 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TROQ12816 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TROQ12816 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
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