Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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GTF3C1Q12789 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF3C1Q12789 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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GTF3C1Q12789 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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GTF3C1Q12789 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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