Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms