Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NCBP1Q09161 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms