Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD47Q08722 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms