Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD300CQ08708 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms