Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4DQ08499 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4DQ08499 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4DQ08499 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4DQ08499 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4DQ08499 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4DQ08499 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4DQ08499 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4DQ08499 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE4DQ08499 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE4DQ08499 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDE4DQ08499 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms