Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCN1BQ07699 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms