Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1T1Q06455 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1T1Q06455 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1T1Q06455 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1T1Q06455 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1T1Q06455 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1T1Q06455 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1T1Q06455 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1T1Q06455 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX1T1Q06455 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms