Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIN1Q05586 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIN1Q05586 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms