Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OC90Q02509 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OC90Q02509 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OC90Q02509 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms