Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1DQ01668 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms