Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BEX3Q00994 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms