Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSG4Q00888 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSG4Q00888 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms