Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms