Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK3Q00526 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms