Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKOR1P84550 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKOR1P84550 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms