Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP1P78357 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms