Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HBBP68871 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HBBP68871 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HBBP68871 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms