Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RHOBP62745 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RHOBP62745 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RHOBP62745 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RHOBP62745 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RHOBP62745 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RHOBP62745 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RHOBP62745 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RHOBP62745 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RHOBP62745 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RHOBP62745 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms