Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms