Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2NP61088 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms