Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVPABLB-1P60509 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms