Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms