Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK4P51957 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK4P51957 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK4P51957 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK4P51957 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK4P51957 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK4P51957 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK4P51957 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK4P51957 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK4P51957 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK4P51957 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK4P51957 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK4P51957 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK4P51957 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK4P51957 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK4P51957 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK4P51957 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK4P51957 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK4P51957 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK4P51957 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms