Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMARCA4P51532 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms