Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE6CP51160 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE6CP51160 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE6CP51160 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE6CP51160 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE6CP51160 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE6CP51160 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE6CP51160 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE6CP51160 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE6CP51160 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE6CP51160 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE6CP51160 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE6CP51160 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE6CP51160 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE6CP51160 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE6CP51160 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE6CP51160 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms