Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK1EP49674 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms