Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRIM1P49642 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms