Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TGM4P49221 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TGM4P49221 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms