Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIA2P42262 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA2P42262 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms