Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms