Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms