Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNB1P35222 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms