Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCC1P33527 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms