Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG3P32926 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG3P32926 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DSG3P32926 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG3P32926 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG3P32926 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG3P32926 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG3P32926 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG3P32926 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG3P32926 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG3P32926 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG3P32926 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG3P32926 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG3P32926 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG3P32926 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG3P32926 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSG3P32926 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms